EQUIVALENCE
CTRM HO2* GTP HO2*
HID HN HID H
HID HND HID HD1
HIE HN HIE H
HIE HNE HIE HE2
HI2 HN HI2 H
HI2 HND HI2 HD1
HI2 HNE HI2 HE1
HIP HN HI2 H
HIP HND HI2 HD1
HIP HNE HI2 HE2
HIP N HI2 N
HID N HISA N
HIE N HISB N
HIP H HI2 H
HID H HISA H
HIE H HISB H
HIP CA HI2 CA
HID CA HISA CA
HIE CA HISB CA
HIP CB HI2 CB
HID CB HISA CB
HIE CB HISB CB
HIP CG HI2 CG
HID CG HISA CG
HIE CG HISB CG
HIP ND1 HI2 ND1
HID ND1 HISA ND1
HIE ND1 HISB ND1
HIP HD1 HI2 HD1
HID HD1 HISA HD1
HIP CE1 HI2 CE1
HID CE1 HISA CE1
HIE CE1 HISB CE1
HIP NE2 HI2 NE2
HID NE2 HISA NE2
HIE NE2 HISB NE2
HIP HE2 HI2 HE2
HIE HE2 HISB HE2
HIP CD2 HI2 CD2
HID CD2 HISA CD2
HIE CD2 HISB CD2
HIP C HI2 C
HID C HISA C
HIE C HISB C
HIP O HI2 O
HID O HISA O
HIE O HISB O
MINE !Charmm19 for sda/UHBD polar hydrogens
resi atom chrg epsi sigm radi end
NTRM HT1 0.400 0.000 0.000 0.713 ! +1 total charge
NTRM HT2 0.400 0.000 0.000 0.713
NTRM HT3 0.400 0.000 0.000 0.713
NTRM N -0.300 0.000 0.000 1.425
NTRM CA 0.100 0.000 0.000 2.107
NTRM C 0.550 0.000 0.000 1.871
NTRM O -0.550 0.000 0.000 1.425
CTRM OXT -0.570 0.000 0.000 1.425 ! Copied from OT1 or 2
CTRM O -0.570 0.000 0.000 1.425 ! Copied from OT1 or 2
CTRM N -0.350 0.000 0.000 1.425 ! -1 total charge
CTRM H 0.250 0.000 0.000 0.535
CTRM CA 0.100 0.000 0.000 2.107
CTRM C 0.140 0.000 0.000 1.871
ALA N -0.350 0.238 2.851 1.425
ALA H 0.250 0.050 1.425 0.713
ALA CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ALA CB 0.000 0.181 3.858 1.929
ALA C 0.550 0.120 3.742 1.871
ALA O -0.550 0.159 2.851 1.425
ALAT N -0.300 0.238 2.851 1.425
ALAT HT1 0.150 0.050 1.425 0.713
ALAT HT2 0.150 0.050 1.425 0.713
ALAT HT3 0.000 0.000 0.000 0.000
ALAT CA 0.000 0.049 4.214 2.107
ALAT CB 0.000 0.181 3.858 1.929
ALAT C 0.550 0.120 3.742 1.871
ALAT O -0.550 0.159 2.851 1.425
ARG N -0.350 0.238 2.851 1.425
ARG H 0.250 0.050 1.425 0.713
ARG CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ARG CB 0.000 0.114 3.982 1.991
ARG CG 0.000 0.114 3.982 1.991
ARG CD 0.100 0.114 3.982 1.991
ARG NE -0.400 0.238 2.851 1.425
ARG HE 0.300 0.050 1.425 0.712
ARG CZ 0.500 0.120 3.742 1.871
ARG NH1 -0.450 0.238 2.851 1.425
ARG HH11 0.350 0.050 1.070 0.535
ARG HH12 0.350 0.050 1.070 0.535
ARG NH2 -0.450 0.238 2.851 1.425
ARG HH21 0.350 0.050 1.070 0.535
ARG HH22 0.350 0.050 1.070 0.535
ARG C 0.550 0.120 3.742 1.871
ARG O -0.550 0.159 2.851 1.425
ARGN N -0.350 0.238 2.851 1.425
ARGN H 0.250 0.050 1.425 0.713
ARGN CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ARGN CB 0.000 0.114 3.982 1.991
ARGN CG 0.000 0.114 3.982 1.991
ARGN CD 0.100 0.114 3.982 1.991
ARGN NE -0.400 0.238 2.851 1.425
ARGN HE 0.300 0.050 1.425 0.712
ARGN CZ -0.200 0.120 3.742 1.871
ARGN NH1 -0.450 0.238 2.851 1.425
ARGN HH11 0.350 0.050 1.070 0.535
ARGN HH12 0.350 0.050 1.070 0.535
ARGN NH2 -0.300 0.238 2.851 1.425
ARGN HH21 0.250 0.050 1.070 0.535
ARGN C 0.550 0.120 3.742 1.871
ARGN O -0.550 0.159 2.851 1.425
GRA N -0.350 0.238 2.851 1.425
GRA H 0.250 0.050 1.425 0.713
GRA CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GRA CB 0.000 0.114 3.982 1.991
GRA CG 0.000 0.114 3.982 1.991
GRA CD 0.100 0.114 3.982 1.991
GRA NE -0.400 0.238 2.851 1.425
GRA HE 0.300 0.050 1.425 0.712
GRA CZ -0.200 0.120 3.742 1.871
GRA NH1 -0.450 0.238 2.851 1.425
GRA HH11 0.250 0.050 1.070 0.535
GRA HH12 0.250 0.050 1.070 0.535
GRA NH2 -0.350 0.238 2.851 1.425
GRA HH21 0.250 0.050 1.070 0.535
GRA HH22 0.250 0.050 1.070 0.535
GRA C 0.550 0.120 3.742 1.871
GRA O -0.550 0.159 2.851 1.425
ASN N -0.350 0.238 2.851 1.425
ASN H 0.250 0.050 1.425 0.712
ASN CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ASN CB 0.000 0.114 3.982 1.991
ASN CG 0.550 0.120 3.742 1.871
ASN OD1 -0.550 0.159 2.851 1.425
ASN ND2 -0.600 0.238 2.851 1.425
ASN HD21 0.300 0.050 1.425 0.712
ASN HD22 0.300 0.050 1.425 0.712
ASN C 0.550 0.120 3.742 1.871
ASN O -0.550 0.120 3.742 1.871
ASPH N -0.350 0.238 2.851 1.425
ASPH H 0.250 0.050 1.425 0.712
ASPH CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ASPH CB 0.000 0.114 3.982 1.991
ASPH CG 0.700 0.120 3.742 1.871
ASPH OD1 -0.550 0.647 2.851 1.425
ASPH OD2 -0.400 0.647 2.851 1.425
ASPH HD 0.250 0.050 1.070 0.535
ASPH C 0.550 0.120 3.742 1.871
ASPH O -0.550 0.159 2.851 1.425
ASP N -0.350 0.238 2.851 1.425
ASP H 0.250 0.050 1.425 0.712
ASP CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ASP CB -0.160 0.114 3.982 1.991
ASP CG 0.360 0.120 3.742 1.871
ASP OD1 -0.600 0.647 2.851 1.425
ASP OD2 -0.600 0.647 2.851 1.425
ASP HD 0.000 0.000 0.000 0.000
ASP C 0.550 0.120 3.742 1.871
ASP O -0.550 0.159 2.851 1.425
ASPZ N 0.000 0.238 2.851 1.425
ASPZ H 0.000 0.050 1.425 0.712
ASPZ CA 0.000 0.049 4.214 2.107
ASPZ CB -0.160 0.114 3.982 1.991
ASPZ CG 0.360 0.120 3.742 1.871
ASPZ OD1 -0.600 0.647 2.851 1.425
ASPZ OD2 -0.600 0.647 2.851 1.425
ASPZ HD 0.000 0.000 0.000 0.000
ASPZ C 0.550 0.120 3.742 1.871
ASPZ O -0.550 0.159 2.851 1.425
CYS N -0.350 0.238 2.851 1.425
CYS H 0.250 0.050 1.425 0.713
CYS CA 0.100 0.049 4.214 2.107
CYS CB 0.190 0.114 3.982 1.991
CYS SG -0.190 0.043 3.368 1.684
CYS HG 0.000 0.000 0.000 0.000
CYS C 0.550 0.120 3.742 1.871
CYS O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLN N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLN H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLN CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GLN CB 0.000 0.114 3.982 1.991
GLN CG 0.000 0.114 3.982 1.991
GLN CD 0.550 0.120 3.742 1.871
GLN OE1 -0.550 0.159 2.851 1.425
GLN NE2 -0.600 0.238 2.851 1.425
GLN HE21 0.300 0.050 1.425 0.712
GLN HE22 0.300 0.050 1.425 0.712
GLN C 0.550 0.120 3.742 1.871
GLN O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLN1 N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLN1 H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLN1 CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GLN1 CB 0.000 0.114 3.982 1.991
GLN1 CG 0.000 0.114 3.982 1.991
GLN1 CD 0.550 0.120 3.742 1.871
GLN1 OE1 -0.550 0.159 2.851 1.425
GLN1 NE2 0.000 0.238 2.851 1.425
GLN1 HE21 0.000 0.050 1.425 0.712
GLN1 HE22 0.000 0.050 1.425 0.712
GLN1 C 0.550 0.120 3.742 1.871
GLN1 O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLUH N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLUH H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLUH CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GLUH CB 0.000 0.181 3.858 1.929
GLUH CG 0.000 0.114 3.982 1.991
GLUH CD 0.700 0.120 3.742 1.871
GLUH OE1 -0.550 0.647 2.851 1.425
GLUH OE2 -0.400 0.647 2.851 1.425
GLUH HE 0.250 0.050 1.070 0.535
GLUH C 0.550 0.120 3.742 1.871
GLUH O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLU N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLU H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLU CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GLU CB 0.000 0.181 3.858 1.929
GLU CG -0.160 0.114 3.982 1.991
GLU CD 0.360 0.120 3.742 1.871
GLU OE1 -0.600 0.647 2.851 1.425
GLU OE2 -0.600 0.647 2.851 1.425
GLU HE 0.000 0.000 0.000 0.000
GLU C 0.550 0.120 3.742 1.871
GLU O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLU1 N -0.100 0.238 2.851 1.425
GLU1 H 0.000 0.050 1.425 0.712
GLU1 CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GLU1 CB 0.000 0.181 3.858 1.929
GLU1 CG -0.160 0.114 3.982 1.991
GLU1 CD 0.360 0.120 3.742 1.871
GLU1 OE1 -0.600 0.647 2.851 1.425
GLU1 OE2 -0.600 0.647 2.851 1.425
GLU1 HE 0.000 0.000 0.000 0.000
GLU1 C 0.550 0.120 3.742 1.871
GLU1 O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLU2 N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLU2 H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLU2 CA 0.100 0.049 4.214 2.107
GLU2 CB 0.000 0.181 3.858 1.929
GLU2 CG -0.160 0.114 3.982 1.991
GLU2 CD 0.360 0.120 3.742 1.871
GLU2 OE1 -0.600 0.647 2.851 1.425
GLU2 OE2 -0.600 0.647 2.851 1.425
GLU2 HE 0.000 0.000 0.000 0.000
GLU2 C 0.000 0.120 3.742 1.871
GLU2 O 0.000 0.159 2.851 1.425
GLY N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLY H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLY CA 0.100 0.114 3.982 1.991
GLY C 0.550 0.120 3.742 1.871
GLY O -0.550 0.159 2.851 1.425
GLYC N -0.350 0.238 2.851 1.425
GLYC H 0.250 0.050 1.425 0.712
GLYC CA 0.100 0.114 3.982 1.991
GLYC C 0.140 0.120 3.742 1.871
GLYC O -0.570 0.159 2.851 1.425
GLYC OXT -0.570 0.159 2.851 1.425
HISA N -0.350 0.238 2.851 1.425
HISA H 0.250 0.050 1.425 0.712
HISA CA 0.100 0.049 4.214 2.107
HISA CB 0.000 0.181 3.858 1.929
HISA CG 0.100 0.120 3.742 1.871
HISA ND1 -0.400 0.238 2.851 1.425
HISA HD1 0.300 0.050 1.425 0.712
HISA CE1 0.300 0.120 3.742 1.871
HISA NE2 -0.400 0.238 2.851 1.425
HISA HE2 0.000 0.000 0.000 0.000
HISA CD2 0.100 0.120 3.742 1.871
HISA C 0.550 0.120 3.742 1.871
HISA O -0.550 0.159 2.851 1.425
HISB N -0.350 0.238 2.851 1.425
HISB H 0.250 0.050 1.425 0.712
HISB CA 0.100 0.049 4.214 2.107
HISB CB 0.000 0.181 3.858 1.929
HISB CG 0.100 0.120 3.742 1.871
HISB ND1 -0.400 0.238 2.851 1.425
HISB HD1 0.000 0.000 0.000 0.000
HISB CE1 0.300 0.120 3.742 1.871
HISB NE2 -0.400 0.238 2.851 1.425
HISB HE2 0.300 0.050 1.425 0.712
HISB CD2 0.100 0.120 3.742 1.871
HISB C 0.550 0.120 3.742 1.871
HISB O -0.550 0.159 2.851 1.425
HISN N -0.350 0.238 2.851 1.425
HISN H 0.250 0.050 1.425 0.712
HISN CA 0.100 0.049 4.214 2.107
HISN CB 0.000 0.181 3.858 1.929
HISN CG 0.100 0.120 3.742 1.871
HISN ND1 -0.400 0.238 2.851 1.425
HISN HD1 0.200 0.000 0.000 0.000
HISN CE1 0.100 0.120 3.742 1.871
HISN NE2 -0.400 0.238 2.851 1.425
HISN HE2 0.300 0.050 1.425 0.712
HISN CD2 0.100 0.120 3.742 1.871
HISN C 0.550 0.120 3.742 1.871
HISN O -0.550 0.159 2.851 1.425
HIS2 N -0.350 0.238 2.851 1.425
HIS2 H 0.250 0.050 1.425 0.712
HIS2 CA 0.100 0.049 4.214 2.107
HIS2 CB 0.100 0.181 3.858 1.929
HIS2 CG 0.150 0.120 3.742 1.871
HIS2 ND1 -0.300 0.238 2.851 1.425
HIS2 HD1 0.350 0.050 1.425 0.712
HIS2 CE1 0.450 0.120 3.742 1.871
HIS2 NE2 -0.300 0.238 2.851 1.425
HIS2 HE2 0.350 0.050 1.425 0.712
HIS2 CD2 0.200 0.120 3.742 1.871
HIS2 C 0.550 0.120 3.742 1.871
HIS2 O -0.550 0.159 2.851 1.425
ILE N -0.350 0.238 2.851 1.425
ILE H 0.250 0.050 1.425 0.712
ILE CA 0.100 0.049 4.214 2.107
ILE CB 0.000 0.049 4.214 2.107
ILE CG1 0.000 0.181 3.858 1.929
ILE CG2 0.000 0.181 3.858 1.929
ILE CD1 0.000 0.181 3.858 1.929
ILE CD 0.000 0.181 3.858 1.929
ILE C 0.550 0.120 3.742 1.871
ILE O -0.550 0.159 2.851 1.425
LEU N -0.350 0.238 2.851 1.425
LEU H 0.250 0.050 1.425 0.712
LEU CA 0.100 0.049 4.214 2.107
LEU CB 0.000 0.114 3.982 1.991
LEU CG 0.000 0.049 4.214 2.107
LEU CD1 0.000 0.181 3.858 1.929
LEU CD2 0.000 0.181 3.858 1.929
LEU C 0.550 0.120 3.742 1.871
LEU O -0.550 0.159 2.851 1.425
LYS N -0.350 0.238 2.851 1.425
LYS H 0.250 0.050 1.425 0.712
LYS CA 0.100 0.049 4.214 2.107
LYS CB 0.000 0.114 3.982 1.991
LYS CG 0.000 0.114 3.982 1.991
LYS CD 0.000 0.114 3.982 1.991
LYS CE 0.250 0.114 3.982 1.991
LYS NZ -0.300 0.238 2.851 1.425
LYS HZ1 0.350 0.050 1.070 0.535
LYS HZ2 0.350 0.050 1.070 0.535
LYS HZ3 0.350 0.050 1.070 0.535
LYS C 0.550 0.120 3.742 1.871
LYS O -0.550 0.159 2.851 1.425
LYSN N -0.350 0.238 2.851 1.425
LYSN H 0.250 0.050 1.425 0.712
LYSN CA 0.100 0.049 4.214 2.107
LYSN CB 0.000 0.114 3.982 1.991
LYSN CG 0.000 0.114 3.982 1.991
LYSN CD 0.000 0.114 3.982 1.991
LYSN CE 0.000 0.114 3.982 1.991
LYSN NZ -0.300 0.238 2.851 1.425
LYSN HZ1 0.150 0.050 1.070 0.535
LYSN HZ2 0.150 0.050 1.070 0.535
LYSN C 0.550 0.120 3.742 1.871
LYSN O -0.550 0.159 2.851 1.425
SYL N -0.350 0.238 2.851 1.425
SYL H 0.250 0.050 1.425 0.712
SYL CA 0.100 0.049 4.214 2.107
SYL CB 0.000 0.114 3.982 1.991
SYL CG 0.000 0.114 3.982 1.991
SYL CD 0.000 0.114 3.982 1.991
SYL CE 0.000 0.114 3.982 1.991
SYL NZ -0.300 0.238 2.851 1.425
SYL HZ1 0.100 0.050 1.070 0.535
SYL HZ2 0.100 0.050 1.070 0.535
SYL HZ3 0.100 0.050 1.070 0.535
SYL C 0.550 0.120 3.742 1.871
SYL O -0.550 0.159 2.851 1.425
MET N -0.350 0.238 2.851 1.425
MET H 0.250 0.050 1.425 0.712
MET CA 0.100 0.049 4.214 2.107
MET CB 0.000 0.114 3.982 1.991
MET CG 0.060 0.114 3.982 1.991
MET SD -0.120 0.043 3.368 1.684
MET CE 0.060 0.181 3.858 1.929
MET C 0.550 0.120 3.742 1.871
MET O -0.550 0.159 2.851 1.425
PHE N -0.350 0.238 2.851 1.425
PHE H 0.250 0.050 1.425 0.712
PHE CA 0.100 0.049 4.214 2.107
PHE CB 0.000 0.114 3.982 1.991
PHE CG 0.000 0.120 3.742 1.871
PHE CD1 0.000 0.120 3.742 1.871
PHE CE1 0.000 0.120 3.742 1.871
PHE CZ 0.000 0.120 3.742 1.871
PHE CE2 0.000 0.120 3.742 1.871
PHE CD2 0.000 0.120 3.742 1.871
PHE C 0.550 0.120 3.742 1.871
PHE O -0.550 0.159 2.851 1.425
PRO N -0.200 0.170 3.250 1.625
PRO CD 0.100 0.114 3.982 1.991
PRO CG 0.000 0.114 3.982 1.991
PRO CB 0.000 0.114 3.982 1.991
PRO CA 0.100 0.049 4.214 2.107
PRO C 0.550 0.120 3.742 1.871
PRO O -0.550 0.159 2.851 1.425
SER N -0.350 0.238 2.851 1.425
SER H 0.250 0.050 1.425 0.712
SER CA 0.100 0.049 4.214 2.107
SER CB 0.250 0.114 3.982 1.991
SER OG -0.650 0.159 2.851 1.425
SER HG 0.400 0.050 1.425 0.712
SER C 0.550 0.120 3.742 1.871
SER O -0.550 0.159 2.851 1.425
THR N -0.350 0.238 2.851 1.425
THR H 0.250 0.050 1.425 0.712
THR CA 0.100 0.049 4.214 2.107
THR CB 0.250 0.049 4.214 2.107
THR CG2 0.000 0.181 3.858 1.929
THR OG1 -0.650 0.159 2.851 1.425
THR HG1 0.400 0.050 1.425 0.712
THR C 0.550 0.120 3.742 1.871
THR O -0.550 0.159 2.851 1.425
THRZ N 0.000 0.238 2.851 1.425
THRZ H 0.000 0.050 1.425 0.712
THRZ CA 0.000 0.049 4.214 2.107
THRZ CB 0.250 0.049 4.214 2.107
THRZ CG2 0.000 0.181 3.858 1.929
THRZ OG1 -0.650 0.159 2.851 1.425
THRZ HG1 0.400 0.050 1.425 0.712
THRZ C 0.550 0.120 3.742 1.871
THRZ O -0.550 0.159 2.851 1.425
TRP N -0.350 0.238 2.851 1.425
TRP H 0.250 0.050 1.425 0.712
TRP CA 0.100 0.049 4.214 2.107
TRP CB 0.000 0.114 3.982 1.991
TRP CG -0.030 0.120 3.742 1.871
TRP CD1 0.060 0.120 3.742 1.871
TRP NE1 -0.360 0.238 2.851 1.425
TRP HE1 0.300 0.050 1.425 0.712
TRP CE2 -0.040 0.120 3.742 1.871
TRP CZ2 0.000 0.120 3.742 1.871
TRP CH2 0.000 0.120 3.742 1.871
TRP CZ3 0.000 0.120 3.742 1.871
TRP CE3 -0.030 0.120 3.742 1.871
TRP CD2 0.100 0.120 3.742 1.871
TRP C 0.550 0.120 3.742 1.871
TRP O -0.550 0.159 2.851 1.425
TYR N -0.350 0.238 2.851 1.425
TYR H 0.250 0.050 1.425 0.712
TYR CA 0.100 0.049 4.214 2.107
TYR CB 0.000 0.114 3.982 1.991
TYR CG 0.000 0.120 3.742 1.871
TYR CD1 0.000 0.120 3.742 1.871
TYR CE1 0.000 0.120 3.742 1.871
TYR CZ 0.250 0.120 3.742 1.871
TYR OH -0.650 0.159 2.851 1.425
TYR HH 0.400 0.050 1.425 0.712
TYR CE2 0.000 0.120 3.742 1.871
TYR CD2 0.000 0.120 3.742 1.871
TYR C 0.550 0.120 3.742 1.871
TYR O -0.550 0.159 2.851 1.425
VAL N -0.350 0.238 2.851 1.425
VAL H 0.250 0.050 1.425 0.712
VAL CA 0.100 0.049 4.214 2.107
VAL CB 0.000 0.049 4.214 2.107
VAL CG1 0.000 0.181 3.858 1.929
VAL CG2 0.000 0.181 3.858 1.929
VAL C 0.550 0.120 3.742 1.871
VAL O -0.550 0.159 2.851 1.425
ASNN N -0.300 0.238 2.851 1.425
ASNN HT1 0.150 0.050 1.425 0.712
ASNN HT2 0.150 0.050 1.425 0.712
ASNN HTA1 0.100 0.050 1.425 0.712
ASNN HTA2 0.100 0.050 1.425 0.712
ASNN HTA3 0.100 0.050 1.425 0.712
ASNN CA 0.000 0.049 4.214 2.107
ASNN CB 0.000 0.114 3.982 1.991
ASNN CG 0.550 0.120 3.742 1.871
ASNN OD1 -0.550 0.159 2.851 1.425
ASNN ND2 -0.600 0.238 2.851 1.425
ASNN HD21 0.300 0.050 1.425 0.712
ASNN HD22 0.300 0.050 1.425 0.712
ASNN C 0.550 0.120 3.742 1.871
ASNN O -0.550 0.159 2.851 1.425
VALC N -0.350 0.238 2.851 1.425
VALC H 0.250 0.050 1.425 0.712
VALC CA 0.100 0.049 4.214 2.107
VALC CB 0.000 0.049 4.214 2.107
VALC CG1 0.000 0.181 3.858 1.929
VALC CG2 0.000 0.181 3.858 1.929
VALC C 0.140 0.120 3.742 1.871
VALC O -0.570 0.647 2.851 1.425
VALC OXT -0.570 0.647 2.851 1.425
VALC HXT 0.000 0.000 0.000 0.000
VALN N -0.350 0.238 2.851 1.425
VALN H 0.250 0.050 1.425 0.712
VALN CA 0.100 0.049 4.214 2.107
VALN CB 0.000 0.049 4.214 2.107
VALN CG1 0.000 0.181 3.858 1.929
VALN CG2 0.000 0.181 3.858 1.929
VALN C 0.140 0.120 3.742 1.871
VALN O -0.070 0.647 2.851 1.425
VALN OXT -0.070 0.647 2.851 1.425
VALN HXT 0.000 0.000 0.000 0.000
LEUC N -0.350 0.238 2.851 1.425
LEUC H 0.250 0.050 1.425 0.712
LEUC CA 0.100 0.049 4.214 2.107
LEUC CB 0.000 0.114 3.982 1.991
LEUC CG 0.000 0.049 4.214 2.107
LEUC CD1 0.000 0.181 3.858 1.929
LEUC CD2 0.000 0.181 3.858 1.929
LEUC C 0.140 0.120 3.742 1.871
LEUC O -0.570 0.647 2.851 1.425
LEUC OXT -0.570 0.647 2.851 1.425
LEUC HXT 0.000 0.000 0.000 0.000
METT N -0.250 0.238 2.851 1.425
METT HT1 0.350 0.050 1.425 0.712
METT HT2 0.350 0.050 1.425 0.712
METT HT3 0.350 0.050 1.425 0.712
METT CA 0.200 0.049 4.214 2.107
METT CB 0.000 0.114 3.982 1.991
METT CG 0.060 0.114 3.982 1.991
METT SD -0.120 0.043 3.368 1.684
METT CE 0.060 0.181 3.858 1.929
METT C 0.550 0.120 3.742 1.871
METT O -0.550 0.238 2.851 1.425
CYSL N -0.350 0.238 2.851 1.425
CYSL H 0.250 0.050 1.425 0.713
CYSL CA 0.100 0.049 4.214 2.107
CYSL CB 0.190 0.114 3.982 1.991
CYSL SG -0.590 0.043 3.368 1.684
CYSL HG 0.000 0.000 0.000 0.000
CYSL C 0.550 0.120 3.742 1.871
CYSL O -0.550 0.159 2.851 1.425
IONP K 1.000 0.010 4.700 2.350
IONN K 0.000 0.010 4.700 2.350
HEM FE 2.000 0.000 1.158 0.579
HEM CHA -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM CHB -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM CHC -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM CHD -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM NA -0.500 0.238 2.851 1.425
HEM C1A 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM C2A -0.071 0.120 3.742 1.871
HEM C3A -0.071 0.120 3.742 1.871
HEM C4A 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM CMA 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM CAA -0.064 0.114 3.982 1.991
HEM CBA -0.214 0.114 3.982 1.991
HEM CGA 0.350 0.120 3.742 1.871
HEM O1A -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM O2A -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM HA 0.000 0.000 0.000 0.000
HEM NB -0.500 0.238 2.851 1.425
HEM C1B 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM C2B -0.072 0.120 3.742 1.871
HEM C3B -0.072 0.120 3.742 1.871
HEM C4B 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM CMB 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM CAB -0.122 0.049 4.214 2.107
HEM CBB -0.044 0.114 3.982 1.991
HEM NC -0.500 0.238 2.851 1.425
HEM C1C 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM C2C -0.072 0.120 3.742 1.871
HEM C3C -0.072 0.120 3.742 1.871
HEM C4C 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM CMC 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM CAC -0.122 0.049 4.214 2.107
HEM CBC -0.044 0.114 3.982 1.991
HEM ND -0.500 0.238 2.851 1.425
HEM C1D 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM C2D -0.071 0.120 3.742 1.871
HEM C3D -0.071 0.120 3.742 1.871
HEM C4D 0.078 0.120 3.742 1.871
HEM CMD 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM CAD -0.064 0.114 3.982 1.991
HEM CBD -0.214 0.114 3.982 1.991
HEM CGD 0.350 0.120 3.742 1.871
HEM O1D -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM O2D -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM HD 0.000 0.000 0.000 0.000
HEM1 FE 2.000 0.000 1.158 0.579
HEM1 CHA 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM1 CHB 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM1 CHC 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM1 CHD 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM1 NA -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM1 C1A 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 C2A -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM1 C3A -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM1 C4A 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 CMA 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM1 CAA -0.064 0.114 3.982 1.991
HEM1 CBA -0.214 0.114 3.982 1.991
HEM1 CGA 0.350 0.120 3.742 1.871
HEM1 O1A -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM1 O2A -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM1 HA 0.000 0.000 0.000 0.000
HEM1 NB -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM1 C1B 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 C2B -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM1 C3B -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM1 C4B 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 CMB 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM1 CAB -0.122 0.049 4.214 2.107
HEM1 CBB -0.044 0.114 3.982 1.991
HEM1 NC -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM1 C1C 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 C2C -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM1 C3C -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM1 C4C 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 CMC 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM1 CAC -0.122 0.049 4.214 2.107
HEM1 CBC -0.044 0.114 3.982 1.991
HEM1 ND -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM1 C1D 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 C2D -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM1 C3D -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM1 C4D 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM1 CMD 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM1 CAD -0.064 0.114 3.982 1.991
HEM1 CBD -0.214 0.114 3.982 1.991
HEM1 CGD 0.350 0.120 3.742 1.871
HEM1 O1D -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM1 O2D -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM1 HD 0.000 0.000 0.000 0.000
HEMN FE 0.000 0.000 1.158 0.579
HEMN CHA 0.028 0.120 3.742 1.871
HEMN CHB 0.028 0.120 3.742 1.871
HEMN CHC 0.028 0.120 3.742 1.871
HEMN CHD 0.028 0.120 3.742 1.871
HEMN NA -0.400 0.238 2.851 1.425
HEMN C1A 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN C2A -0.021 0.120 3.742 1.871
HEMN C3A -0.021 0.120 3.742 1.871
HEMN C4A 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN CMA 0.156 0.181 3.858 1.929
HEMN CAA -0.064 0.114 3.982 1.991
HEMN CBA -0.014 0.114 3.982 1.991
HEMN CGA 0.350 0.120 3.742 1.871
HEMN O1A -0.200 0.647 2.851 1.425
HEMN O2A -0.200 0.647 2.851 1.425
HEMN HA 0.000 0.000 0.000 0.000
HEMN NB -0.400 0.238 2.851 1.425
HEMN C1B 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN C2B -0.022 0.120 3.742 1.871
HEMN C3B -0.022 0.120 3.742 1.871
HEMN C4B 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN CMB 0.156 0.181 3.858 1.929
HEMN CAB -0.122 0.049 4.214 2.107
HEMN CBB -0.044 0.114 3.982 1.991
HEMN NC -0.400 0.238 2.851 1.425
HEMN C1C 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN C2C -0.022 0.120 3.742 1.871
HEMN C3C -0.022 0.120 3.742 1.871
HEMN C4C 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN CMC 0.156 0.181 3.858 1.929
HEMN CAC -0.122 0.049 4.214 2.107
HEMN CBC -0.044 0.114 3.982 1.991
HEMN ND -0.400 0.238 2.851 1.425
HEMN C1D 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN C2D -0.021 0.120 3.742 1.871
HEMN C3D -0.021 0.120 3.742 1.871
HEMN C4D 0.128 0.120 3.742 1.871
HEMN CMD 0.156 0.181 3.858 1.929
HEMN CAD -0.064 0.114 3.982 1.991
HEMN CBD -0.014 0.114 3.982 1.991
HEMN CGD 0.350 0.120 3.742 1.871
HEMN O1D -0.200 0.647 2.851 1.425
HEMN O2D -0.200 0.647 2.851 1.425
HEMN HD 0.000 0.000 0.000 0.000
HEM2 FE 2.000 0.000 1.158 0.579
HEM2 CHA 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM2 CHB 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM2 CHC 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM2 CHD 0.028 0.120 3.742 1.871
HEM2 NA -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM2 C1A 0.064 0.120 3.742 1.871
HEM2 C2A -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM2 C3A -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM2 C4A 0.064 0.120 3.742 1.871
HEM2 CMA 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM2 CAA 0.064 0.114 3.982 1.991
HEM2 CBA -0.214 0.114 3.982 1.991
HEM2 CGA 0.350 0.120 3.742 1.871
HEM2 O1A -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM2 O2A -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM2 HA 0.000 0.000 0.000 0.000
HEM2 NB -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM2 C1B 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM2 C2B -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM2 C3B -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM2 C4B 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM2 CMB 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM2 CAB -0.122 0.049 4.214 2.107
HEM2 CBB -0.044 0.114 3.982 1.991
HEM2 NC -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM2 C1C 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM2 C2C -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM2 C3C -0.022 0.120 3.742 1.871
HEM2 C4C 0.128 0.120 3.742 1.871
HEM2 CMC 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM2 CAC -0.122 0.049 4.214 2.107
HEM2 CBC -0.044 0.114 3.982 1.991
HEM2 ND -0.400 0.238 2.851 1.425
HEM2 C1D 0.064 0.120 3.742 1.871
HEM2 C2D -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM2 C3D -0.021 0.120 3.742 1.871
HEM2 C4D 0.064 0.120 3.742 1.871
HEM2 CMD 0.156 0.181 3.858 1.929
HEM2 CAD 0.064 0.114 3.982 1.991
HEM2 CBD -0.214 0.114 3.982 1.991
HEM2 CGD 0.350 0.120 3.742 1.871
HEM2 O1D -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM2 O2D -0.600 0.647 2.851 1.425
HEM2 HD 0.000 0.000 0.000 0.000
CAM C1 0.000 0.026 4.437 2.218
CAM C2 0.550 0.120 3.742 1.871
CAM C3 0.000 0.114 3.982 1.991
CAM C4 0.000 0.049 4.214 2.107
CAM C5 0.000 0.114 3.982 1.991
CAM C6 0.000 0.114 3.982 1.991
CAM C7 0.000 0.026 4.437 2.218
CAM C8 0.000 0.181 3.858 1.929
CAM C9 0.000 0.181 3.858 1.929
CAM C10 0.000 0.181 3.858 1.929
CAM O -0.550 0.159 2.851 1.425
CAMO C1 0.000 0.026 4.437 2.218
CAMO C2 0.000 0.120 3.742 1.871
CAMO C3 0.000 0.114 3.982 1.991
CAMO C4 0.000 0.049 4.214 2.107
CAMO C5 0.000 0.114 3.982 1.991
CAMO C6 0.000 0.114 3.982 1.991
CAMO C7 0.000 0.026 4.437 2.218
CAMO C8 0.000 0.181 3.858 1.929
CAMO C9 0.000 0.181 3.858 1.929
CAMO C10 0.000 0.181 3.858 1.929
CAMO O 0.000 0.159 2.851 1.425
DEB C1 0.550 0.120 3.742 1.871
DEB C2 0.000 0.049 4.214 2.107
DEB C3 0.250 0.049 4.214 2.107
DEB C4 0.000 0.049 4.214 2.107
DEB C5 0.250 0.049 4.214 2.107
DEB C6 0.000 0.049 4.214 2.107
DEB C7 0.000 0.114 3.982 1.991
DEB C8 0.000 0.049 4.214 2.107
DEB C9 0.550 0.120 3.742 1.871
DEB C10 0.000 0.049 4.214 2.107
DEB C11 0.250 0.049 4.214 2.107
DEB C12 0.000 0.049 4.214 2.107
DEB C13 0.400 0.049 4.214 2.107
DEB C14 0.000 0.114 3.982 1.991
DEB C15 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB C18 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB C20 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB C22 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB C23 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB C25 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB C27 0.000 0.181 3.858 1.929
DEB O16 -0.400 0.159 2.851 1.425
DEB O17 -0.550 0.159 2.851 1.425
DEB O19 -0.650 0.159 2.851 1.425
DEB O21 -0.650 0.159 2.851 1.425
DEB O24 -0.550 0.159 2.851 1.425
DEB O26 -0.650 0.159 2.851 1.425
DEB H27 0.400 0.050 1.425 0.712
DEB H28 0.400 0.050 1.425 0.712
DEB H29 0.400 0.050 1.425 0.712
MO4 MG 2.000 0.000 0.000 1.439
GTP PG 1.10 0.000 0.000 1.800!from CHARMM27 paramameters for Guanine
GTP O1G -0.90 0.000 0.000 1.550!and ATP (3 P from ATP)
GTP O2G -0.90 0.000 0.000 1.550
GTP O3G -0.90 0.000 0.000 1.550
GTP O3B -0.86 0.000 0.000 1.550!charge adj. to yield total triP of -4.0
GTP PB 1.50 0.000 0.000 1.800
GTP O1B -0.82 0.000 0.000 1.550
GTP O2B -0.82 0.000 0.000 1.550
GTP O3A -0.74 0.000 0.000 1.550
GTP PA 1.50 0.000 0.000 1.800
GTP O1A -0.82 0.000 0.000 1.550
GTP O2A -0.82 0.000 0.000 1.550
GTP O5* -0.62 0.000 0.000 1.550
GTP C5* -0.08 0.000 0.000 1.800
GTP H5*1 0.09 0.000 0.000 1.330
GTP H5*2 0.09 0.000 0.000 1.330
GTP C4* 0.16 0.000 0.000 1.800 !All from GUA
GTP H4* 0.09 0.000 0.000 1.330
GTP O4* -0.50 0.000 0.000 1.550
GTP C1* 0.16 0.000 0.000 1.800
GTP H1* 0.09 0.000 0.000 1.330
GTP C3* 0.14 0.000 0.000 1.800 !
GTP H3* 0.09 0.000 0.000 1.330 !
GTP O3* -0.66 0.000 0.000 1.550 !This set from ATP
GTP HO3* 0.43 0.000 0.000 1.330 !
GTP C2* 0.14 0.000 0.000 1.800
GTP H2* 0.09 0.000 0.000 1.330
GTP O2* -0.66 0.000 0.000 1.550
GTP HO2* 0.43 0.000 0.000 1.330
GTP N9 -0.02 0.000 0.000 1.650
GTP C4 0.26 0.000 0.000 1.800
GTP N2 -0.68 0.000 0.000 1.650
GTP H2A 0.32 0.000 0.000 1.330
GTP H2B 0.35 0.000 0.000 1.330
GTP N3 -0.74 0.000 0.000 1.650
GTP C2 0.75 0.000 0.000 1.800
GTP N1 -0.34 0.000 0.000 1.650
GTP H1 0.26 0.000 0.000 1.330
GTP C6 0.54 0.000 0.000 1.800
GTP O6 -0.51 0.000 0.000 1.550
GTP C5 0.00 0.000 0.000 1.800
GTP N7 -0.60 0.000 0.000 1.650
GTP C8 0.25 0.000 0.000 1.800
GTP H8 0.16 0.000 0.000 1.330
Privacy Imprint